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GSTPi三位点等位基因组合分布与难治性癫痫的相关性

             作者:杨娟,黄祖春,张婧,王雪峰,席志琴,谢正祥

【摘要】  目的: 探索谷胱苷肽s转移酶pi (gstpi)基因3个位点(ile105val,ala114val,asp147tyr)的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,snp)的基因组合分布与难治性癫痫的相关性. 方法 : 采用等位基因特异性引物pcr技术对非难治性癫痫组、难治性癫痫组、正常组进行gstpi 3个位点snps的检测. 结果: 正常组与癫痫组(包括难治性和非难治性两组)3个位点中单个位点的基因型构成在两组间差异均有统计学意义(p<0.0001). 从组合基因来 分析 ,两个位点均变异的癫痫组20例(21.74%)高于正常组10例(2.17%),差异有统计学意义(p<0.0001); 3个位点均变异的癫痫组68例(78.91%)高于正常组3例(6.52%), 非难治性癫痫组41例(83.67%)高于难治性癫痫组27例(62.79%),差异均有统计学意义(p<0.0001). 结论: gstpi基因变异尤其是多个位点变异的人群易患癫痫,而多个位点变异的患者不易 发展 成难治性癫痫.

【关键词】  单核苷酸多态性;癫痫;谷胱甘肽转移酶;组合分布

  【abstract】aim:  to study single nucleotide polymorphisms(snp) in the 3 sites(ile105val, ala114val, asp147tyr) of gstpi and the association between distribution of component genotype and drugresistant epilepsy. methods: the snps of the three sites of gstpi for healthy people, drugresponsive epilepsy and drugresistant epilepsy were genotyped by allelespecific primerpolymerase chain reaction (asppcr) technique. results:  genotype distribution of every site among the 3 sites is different significantly between healthy group and epilepsy group (p<0.0001). a situation wss that 2 sites of 3 mutated, of which there were 20(21.74%) people in epilepsy group and 10(2.17%) people in control group, and the former was obviously higher than the latter(p<0.0001). another situation was that all of 3 sites mutated, of which there were 68(78.91%) people in epilepsy group, 3(6.52%) people in control group, and the former was obviously higher than the latter(p<0.0001).the same as foregoing, 41(83.67%) people in drugresponsive epilepsy group and  27(62.79%) people in drugresistant epilepsy group, and the former was obviously higher than the latter(p<0.0001). conclusion: people with mutated gene are easy to get epilepsy, obviously the people with mutated gene of multitude sites, but these people are not easy to develop drugresistant epilepsy. 

  【keywords】 single nucleotide polymorphisms; epilepsy; component genotype; allele

  0 引言
    
   目前 国内外有关与癫痫相关的基因 研究 较多的有白介素1 r (inter leukin1 r, il1r)基因,il1受体抗体(il1 receptor antagonist, il111a)基因、载脂蛋白e (apolipo protein e, apoe) s4等位基因、gaba基因及朊蛋白基因(prion protein, prnp). 而对难治性癫痫的研究多围绕多药耐药家族进行. 有研究[1]表明在 中国 人群中表达pgp的多耐药基因(multidrug resistance, mdr1)的基因多态性与难治性癫痫有相关性,而多药耐药组基因中的gstpi基因的多态性与难治性癫痫的关系尚少见报道,且目前其它关于基因多态性与整体生理和疾病表现型联系的研究,多数只局限于单个基因,甚至是单个位点的多态性[2-3]. 我们通过观察gstpi 3位点snps的组合分布与难治性癫痫的相关性,旨在分析gstpi基因变异是否逃逸难治性癫痫的发生.

  1  对象和方法

  1.1  对象  选择重庆医科大学附属第一 医院 癫痫门诊患者104例. 其中非难治性癫痫患者55(男31,女24)例;难治性癫痫患者49(男28,女21)例. 患者年龄[39±4(9~58)]岁. 所有癫痫患者均符合国际抗癫痫联盟1981发作分类[4],其中难治性癫痫组患者符合国内难治性癫痫诊断标准[5]. 正常对照组随机选择重庆医科大学附属第一医院体检中心健康个体70(男38,女32)例,年龄[41±2(23~65)]岁. 入选标准:血压<140/90 mmhg; 无心、脑、肾、肝胆、糖尿病等病史;心电图、尿常规、肝肾功能、血糖及血脂均正常者. dyy11型电脑三恒多用电泳仪,wd9403d型紫外分析仪(北京六一仪器厂);taq酶(中国大连宝生物有限公司). 取乙二胺四乙酸抗凝的外周静脉全血1 ml,用dna提取专业试剂盒(由上海华舜生物工程有限公司)抽提白细胞染色体基因组dna,-20℃保存备用.

  1.2  方法

  1.2.1  引物设计  基因序列来自pubmed 网络 资源的基因库,序列号为:x08058,采用网络下载软件primer 5.0进行引物序列设计,采用美国卫生研究所生物信息中心的blast 2.0软件进行引物性能检测,由大连宝生物技术有限公司提供引物合成. ile105val位点的上游序列ctcaccctgtaccagtccaat作为公用引物. 当单核苷酸为a(野生型)时,下游引物为atagttggtgtagatgagggagat;当单核苷酸为g(变异型)时,下游引物为atagttggtgtagatgagggagac. ala114val位点的下游序列accctcactgtttcccgttgc作为公用引物. 当单核苷酸为c(野生型)时,上游引物为ggtggtgtctggcaggaggc;当单核苷酸为t(变异型)时,上游引物为ggtggtgtctggcaggaggt. asp147tyr位点的下游序列cctcactgtttcccgttgc作为公用引物,当单核苷酸为g(野生型)时,上游引物为caagaccttcattgtgggag;当单核苷酸为t(变异型)时,上游引物为caagaccttcattgtgggat.

  1.2.2  pcr反应体系  taq酶0.2 μl,10×ex buffer 3 μl, mgcl2 2 μl, dntp 2 μl, 上游、下游引物分别1 μl, 模板dna 3 μl, 加水至25 μl. ile105val 位点的循环体条件为94℃ 3 min预变性一个循环,94℃ 30 s变性,61℃ 30 s退火,72℃ 1 min延伸,共35个循环,最后72℃ 10 min延伸1个循环. ala114val位点的循环体条件为94℃ 3 min预变性1个循环,94℃ 30 s变性,64℃ 30 s退火,72℃ 1 min延伸,共35个循环;72℃ 10 min延伸1个循环. asp147 tyr位点的循环体条件为94℃ 3 min预变性1个循环,94℃ 30 s变性,57℃ 30 s退火,72℃ 1 min延伸,共35个循环,72℃ 10 min延伸1个循环.

  1.2.3  snps的检测  采用单一等位基因特异性引物pcr技术(single allelespecific primer, sasppcr)对gatpi基因的snps分别进行野生型和变异型检测[6].
   
  统计学处理: 应用 spss 15. 0 统计软件包处理数据. 所用统计分析方法为χ2检验.

  2  结果
   
  癫痫组与正常对照组的年龄及性别比较,差异无统计学意义(p>0.05).

  2.1  asppcr技术测定的gstpi 3位点的基因型  等位基因特异性引物pcr(asppcr)技术测定的gstpi基因3位点(ile105val,ala114val和asp147tyr)的snp 3种基因型,其中图1 为ile 105 val的3种基因型aa,ag和gg,pcr长度为512 bp;图2为ala114val的3种基因型ct,tt和cc,pcr长度为493 bp;图3为asp147tyr的3种基因型gg,gt和tt,pcr长度为393 bp.

  m: 50 bp dna marker,内参位在193 bp ; 1~2: ile/ile(aa野生型纯合子); 3~4: ile/val(ag杂合子); 5~6: val/val(gg变异型纯合子).

  图1  gstpi 基因3位点ile105val的3种基因型(略)

  m: 50 bp dna marker,内参位在193 bp; 1~2:ala/val (ct杂合子); 3~4:val/val(tt变异型纯合子);5~6: ala /ala (cc野生型纯合子).

  图2  gstpi 基因3位点ala114val的3种基因型(略)

  2.2  单个位点基因型分布  正常对照组与癫痫组单个位点基因型分布见表1. 两组间单个位点基因型构成差异具有统计学意义(p<0.0001,ile105val:χ2=63.29,ala114val:χ2=87.77,asp147tyr:χ2=79.49);组内不同性别间差异无统计学意义(p>0.05,校正χ2检验). 难治性癫痫组与非难治性癫痫组单个位点基因型分布见表2. 两组间单个位点基因型构成差异无统计学意义(p>0.05, 校正χ2检验). 组间及组内不同性别间差异均无统计学意义(p>0.05,校正χ2检验).

  m: 50 bp dna marker,内参位在193 bp ; 1~2: asp/asp(gg野生型纯合子); 3~4: asp/tyr(gt杂合子); 5~6: tyr/tyr(tt变异型纯合子).

  图3  gstpi 基因3位点asp147tyr的3种基因型(略)

  表1  癫痫组与正常对照组gstpi 3位点基因型分布频率(略)

  2.3  组合基因分布  正常对照组中无位点突变19例,1个位点突变14例,两个位点突变10例,3个突变3例;而癫痫组依次为0,4,20和68例,两组比较差异具有统计学意义(p<0.0001, χ2=79.02). 3个位点均突变的比例癫痫组显著高于正常对照组(表3). 难治性癫痫组中无位点突变0例,1个位点突变3例,2个位点突变13例,3个位点突变27例;非难治性癫痫组依次为0,1,7和41例,两组差异具有统计学意义(p<0.05,χ2=5.18),3个位点都突变的患者比例难治性癫痫组显著低于非难治性癫痫组(表4).

  表2  难治性癫痫组与非难治性癫痫组gstpi 3位点基因型分布频率(略)

  表3  对照组与癫痫组gstpi 3位点组合基因的分布频率(略)

  注:*为1个位点变异;**为2个位点变异;***为3个位点均变异.

  表4  难治性癫痫组与非难治癫痫组gstpi组合基因的分布(略)

  注:*为1个位点变异;**为2个位点变异;***为3个位点均变异.

  3  讨论
   
  我们发现gstpi基因突变尤其是多个位点基因突变与癫痫易感性相关,说明gstpi基因突变可能参与了癫痫的发病. 推测其机制可能与gstpi的c端功能相关. 有 研究 [7]报道未变异的gstpi基因c端功能正常,表达的gstpi蛋白能与cjun氨基末端激酶(jnk)的结合而抑制jnk活性,从而对细胞凋亡、增殖、分化、应激进行调节[8-10]. 而基因变异可能引起gstpi的c端不能发挥正常功能进而引起凋亡、增殖、分化、应激功能的紊乱,所以可能在某些诱因下易发癫痫.
   
  本研究还发现gstpi 基因单个位点变异对癫痫是否 发展 成难治性不相关,但多个位点变异特别是3个位点均变异的人群不易发展成为难治性癫痫. 推测其机制可能是gstpi基因的多个位点突变 影响 了其n端功能. 未变异的gstpi基因n端表达gstpi蛋白,具有催化还原型谷胱甘肽与亲脂性抗癫痫药物结合,从而将抗癫药还原成亲水物质排出体外的功能,如肖争等[11]及彭佑群等[12]研究所示gstpi蛋白表达增高会导致难治性癫痫的发生. 而基因多个位点变异可能导致gstpi的n端不能发挥正常功能,不能表达正常的gstpi蛋白,不能通过催化还原型谷胱甘肽与亲脂性抗癫痫药物结合,进而不会将抗癫药还原成亲水物质排出体外,不易发展成耐药性癫痫. 该发现从另一个角度也支持关于gstpi是耐药基因的学说[11-12]. 本实验对gstpi基因的初步研究为癫痫的发病机制提供一点新思考. 该基因究竟如何参与癫痫发生、规避癫痫难治的确切机制尚需进一步研究.

【 参考 文献 】
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  [12] 彭佑群,王景周,王学峰. 托吡醋对大鼠星形细胞内谷胱苷肽硫转移酶及多药耐受基因的影响[j].

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