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ABCA1基因多态性与血浆载脂蛋白A1水平的关系

             作者:李亚,王玉明,王丹,贺勇  

【摘要】  目的:探讨汉族人群腺苷三磷酸结合盒转运体a1(abca1)基因单核苷酸多态性(snp)与血浆载脂蛋白a1(apoa1)水平的关系. 方法 :选取abca1基因r219k, v825i, m883i和r1587k等4个编码区snps,采用pcr限制性片断长度多态性 分析 技术确定376名健康个体基因型;用thesias程序分析snps的连锁不平衡关系及单倍型. 结果:受检人群中,4种snps各自不同基因型个体间apoa1水平差异均未见统计学意义(p>0.05). r219k与m883i, v825i与m883i以及v825i与r1587k两两间存在连锁不平衡(p<0.01). 以v825i 和r1587k 构建的两位点单倍型中,ik单倍型携带者apoa1水平较vr单倍型携带者显著降低(p<0.05). 结论:abca1基因v825i和r1587k多态性与汉族人群血浆apoa1水平变化有关,但这种关联取决于该两个snps间形成的单倍型.

【关键词】  abca1基因;载脂蛋白a1;单倍体型;连锁不平衡

    0引言

    血浆高密度脂蛋白胆固醇(highdensity lipoprotein cholesterol,hdlc)水平降低是冠心病的独立危险因素之一[1]. 腺苷三磷酸结合盒转运体a1(atpbinding cassette transporter a1,abca1)介导胆固醇、磷脂从肝外组织的流出,并通过与载脂蛋白a1(apolipoprotein a1,apoa1)相互作用,在胆固醇逆向转运和高密度脂蛋白(highdensity lipoprotein,hdl)生成的起始阶段发挥着关键的作用,因此,abca1被认为是决定hdlc水平的主要因素之一[2]. 群体遗传学 研究 表明,abca1基因的某些单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,snp)可改变abca1蛋白活性并由此引起hdlc水平变化,从而 影响 个体对冠心病的易感性[3-4]. 然而,有关abca1基因snps对血浆apoa1水平影响的研究报道却相对缺乏.为此我们在本研究中探讨了abca1基因4种snps及其构成的单倍型与汉族人群apoa1水平变化的关系.

    1对象和方法

    1.1对象来自四川大学华西 医院 和成都医学院第一附属医院无血缘关系的四川地区汉族体检个体376(男194,女182)例,年龄(58.4±8.6)岁,apoa1水平(1.324±0.186) g/l,体质量指数(24.62±3.39) kg/m2,总吸烟率为27%,并经询问病史、体检、心电图等检查排除心血管疾病史.

    1.2方法

    1.2.1标本采集与处理禁食12 h后抽取研究对象外周血5 ml,采用免疫比浊法并按试剂盒(上海荣盛生物技术公司)推荐条件测定血浆apoa1水平;另采集外周血3 ml,1 ml acd抗凝,盐析法提取dna,te缓冲液溶解dna并置于4 ℃冰箱中备用.

    1.2.2多态位点的基因型分型采用pcr限制性片断长度多态性分析法对4个snps进行分型. 首先,参照基因组序列(genbank登录号:nm005502)设计合成相应pcr引物,对受检者abca1基因r219k,v825i,m883i和r1587k等4个snps位点所包含的dna序列进行扩增;再取扩增产物15 μl,分别加入4 u限制性内切酶和2 μl 酶切缓冲液,并加超纯水至总体积20 μl,37℃水浴中保温16 h;最后,消化产物经30 g/l琼脂糖凝胶电泳后,用凝胶成像系统分析电泳结果,判定个体基因型. pcr反应条件、限制性内切酶以及各基因型酶切情况见表1.表1abca1基因snps的基因型分型

    统计学处理:每个snp的hardyweinberg平衡检验用χ2检验,在hwe软件上进行. 单个snp位点基因型与apoa1水平的关系分析采用协方差分析(用spss10.0软件). snps间配对连锁不平衡估算以及各种单倍型与apoa1水平的关联分析均使用thesias程序进行. apoa1水平用x±s表示;除连锁不平衡检验用α=0.001为检验水准外,其余统计学分析均以p≤0.05为差异有统计学意义.

    2结果

    2.1等位基因和基因型的频率分布经χ2检验,4种snps各基因型频率在本研究人群中分布符合hardyweinberg平衡(p>0.05),表明本研究样本具有群体代表性. 其中,变异型等位基因k219和i825的频率高于欧美人群(0.452 vs 0.27, 0.323 vs 0.056,p<0.01);而i883等位基因在欧美人群则为野生型等位基因[5] (表2). 表24种多态位点等位基因和基因型频率

    2.24种snps不同基因型与apoa1水平的关系分析为准确地反映不同基因型对血浆apoa1水平的影响,我们采用了协方差分析,以排除各种混杂因素对研究结果的影响. 校正协变量(年龄、吸烟和体质量指数)后的结果显示,r219k, v825i, m883i和r1587k多态各自不同基因型个体间apoa1水平差异均无统计学意义(p>0.05, 表3). 表34种多态位点不同基因型个体间apoa1水平比较

    2.3配对连锁不平衡分析abca1基因4个snps位点的配对连锁不平衡用统计量d′表示(d′=d/dmax). 表4可见,在全部6个配对组合中,v825i分别与m883i和r1587k间存在较强的连锁不平衡(d′>0.7). 此外,在r219k和m883i间也检测到有统计学意义的连锁不平衡(d′=0.572). 值得注意的是,在r219k至r1587k位点约1.36 kb范围内,我们未发现2个以上的snps位点彼此间的连锁不平衡关系.

    2.4abca1基因单倍型与apoa1水平的关联 分析 由于在分析区域内未检测到3或4个snps位点彼此间的连锁不平衡,我们仅以具有连锁不平衡关系的snps构建两位点单倍型,分析这些单倍型与apoa1水平变化的关系. 表5显示,以v825i 和r1587k构建的单倍型中,ik单倍型携带者其apoa1水平较vr单倍型携带者明显降低[-0.177(-0.269~-0.09),p=0.036].表4abca1基因snps间配对连锁不平衡系数和统计学意义表5各种单倍型与apoa1水平的关联分析

    3讨论

    apoa1是hdl主要的载脂蛋白,占其整个结构蛋白的70%. 正如hdl水平与冠心病发生呈高度负相关[1],个体apoa1水平降低,患冠心病风险也将随之增大. 因此,对apoa1代谢调控因素的 研究 也是冠心病病因学的重要 内容 . 研究发现,作为一种跨膜转运蛋白,abca1在促进胆固醇的细胞流出过程中需借助与apoa1间的相互作用,将先转运出的磷脂结合到apoa1上,形成磷脂apoa1复合物;然后再以该复合物为受体,接受从细胞中流出的胆固醇,进而形成新生的hdl;若转运至胞外的胆固醇量不足,导致磷脂apoa1复合物不能充分与之结合,则多余的apoa1将在肾脏中很快被清除[6],提示abca1活性与血浆apoa1水平可能存在一定的相关性.

    本研究结果表明,汉族人群abca1基因snps与apoa1水平变化的关系明显不同于欧美人群. 本研究中4种snps各自不同基因型个体间apoa1水平均未见显著性差异,提示汉族人群apoa1水平不与abca1基因上述单个snp位点直接关联.

    此外,这种差异还反映在受检dna区域单倍型组成及其与apoa1水平的关系上. 欧美人群中,abca1基因r219k至m883i间各snp两两间处于强连锁不平衡状态(d′>0.9),呈现出典型的单倍型模块(haplotype block)结构;而与之相距较远的r1587k则平衡传递[5]. 然而,本研究人群中对应的各snp位点间不仅连锁不平衡强度低于欧美人群,也未检测到2个以上位点彼此间的连锁不平衡. 我们基于连锁不平衡关系构建了两位点单倍型, 结果发现,在v825i和r1587k构建的单倍型中,ik单倍型携带者apoa1水平较vr单倍型携带者明显降低,提示由v825i和r1587k构成的单倍型与汉族人群apoa1水平变化具有相关性.

    本研究结果与 文献 [5]报道有较大差异. 我们认为,可能有以下3方面原因:首先,本文的资料来自汉族一般人群, 而tregouet等的研究对象则是冠心病患者, 二者脂蛋白代谢过程应该有所不同; 其次, 种族间的遗传背景差异也可能使相同的变异产生不同的表型效应; 另外, apoa1水平作为一种受多种因素 影响 的表型性状, 还可能与不同人群所处的生活环境有关.

【 参考 文献】
  [1] abbott rd, wilson pw, kannel wb, et al. high density lipoprotein cholesterol, total cholesterol screening, and myocardial infarction: the framingham study[j]. arteriosclerosis,1988, 8(3): 207-211.

[2] jonathan c, cohen, robert s, et al. multiple rare alleles contribute to low plasma levels of hdl cholesterol[j]. science, 2004, 305(6): 869-872.

[3] brunham lr, singaraja rr, hayden mr, et al. variations on a gene: rare and common variations in abca1 and their impact on hdl cholesterol and atherosclerosis [j]. annu rev natr, 2006, 26:105-129.

[4] singaraja rr, liam r, kastelein jp,et al. efflux and atherosclerosis: the clinical and biochemical impact of variations in the abca1 gene[j]. arterioscler thromb vasc biol, 2003, 23(8): 1322-1332.

[5] tregouet da, richard s, nicaud v, et al. indepth haplotype analysis of abca1 gene polymorphisms in relation to plasma apo1 levels and myocardial infarction[j]. arterioscler thromb vasc biol, 2004, 24(4):775-781.

[6] attie ad, kastelein jp, hayden mr. pivotal role of abca1 in reverse cholesterol transport influencing hdl levels and susceptibility to atherosclerosis[j]. j lipid res, 2001, 42(11): 1717-1726.

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