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RNAi非特异效应干扰素的反应与探讨

【摘要】   背景与目的 rna干扰(rna interference,rnai)是一项针对转录后特异序列基因沉默的技术,可用于调控基因表达和研究基因功能。但该技术引发的非特异效应也越来越受到重视。其中,干扰素反应为rnai非特异效应的主要类型之一。本文拟探讨在rna干扰实验中干扰素反应的检测。方法 在a549人肺癌细胞株中应用基因转染技术研究5个不同的flj20420 sirna对flj20420基因沉默情况;应用real-time pcr和基因芯片技术相结合,分别检测经2个不同flj20420-sirna干扰后a549细胞中干扰素激活基因(isgs)表达谱的变化情况。结果 ①在a549细胞中,5个不同的flj20420-sirna可不同程度地对目的基因起到沉默作用,其中flj20420-sirna-1和flj20420-sirna-4两个的沉默效果最佳,分别为80%和90%;②应用real-time pcr检测与干扰素反应激活相关的16个主要标志性基因发现,a549-flj-sirna-1细胞中有14个基因的表达明显上调;而a549-flj-sirna-4细胞中仅有2个基因的表达变化差异具有显著性,提示在a549-flj-sirna-1细胞中发生了rnai的非特异性效应;③基因芯片分析发现在a549-fljsirna-1细胞中有51个干扰素激活基因(isgs)表达上调2倍以上(p <0.05),而在a549-flj-sirna-4细胞中仅有6个干扰素激活基因(isgs)表达上调2倍以上(p <0.05),从而证实了a549-flj-sirna-1细胞中存在rnai的非特异性效应干扰素反应。Www.11665.COM结论 在进行rnai实验时,sirna不仅能针对目的基因产生沉默效果,也可同时诱发干扰素反应。应用real-time pcr对于主要的干扰素激活基因(isgs)的mrna表达变化的检测将有助于发现rnai非特异效应干扰素反应。

【关键词】  rnai;flj20420;干扰素反应;干扰素激活基因

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  •  作者:11665 [标签: 非特 效应 干扰素 反应 ]
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